原晉東南衛生學校始建于1951年，60年代初自然災害時期停辦，1972年底經省政府批準，恢復重建，定名為晉東南地區衛生學校，隸屬于晉東南地區行署衛生局領導。
原長治市衛校的前身是1965年在市醫院創辦的市衛生學校和1972年成立的市衛生訓練班；1979年根據山西省人民政府1979年14號文件，長治市衛生學校正式成立，校址暫租借在長治市環衛處；1980年征地4.9畝，校址建在長治市城東路桃園街。
長治衛生學校是2000年10月經山西省人民政府批準，由1951年創建的晉東南地區衛生學校和1965年成立的長治市衛生學校合并成立，位于長治市城區，有東、南兩個校區和一所附屬醫院，隸屬于長治市衛生局。
